德川幕府的天主教禁令始自家康，到了二代将军秀忠手上更为严厉，三代将军家光则彻底实行且临之以严刑峻法。织田、丰臣的天主教全盛时代，许多大名自己都入了教，尤其在九州，大部分的大名都是教徒。及至秀忠、家光两代严令禁压，他们只得迎合幕府的意旨，也实行禁令了。
未转国肥后之前，小仓城主细川忠兴侯的夫人便是著名的虔诚信徒，洗礼后称格拉西雅夫人。忠兴侯自己虽非教友，但也偏袒教徒，予以保护。可是，到后来他却也不得不服从德川的禁令。
在小川领内，也有不少信徒被逮捕、被投狱，罪重的则被解往长崎殉教而死。藩士中也有信徒，最著名的当推贺山隼人一族。隼人是细川家食禄七千石的重臣，但不肯接受忠兴侯的劝告放弃信仰，被撤职、被幽禁，终于穿着修道服升天了。其养子玄也，也是虔诚的信徒，被追放降为贫农，但仍坚持着虔诚的信仰生活。
据《日本天主教史》上的记载：
这位出身名门而生活优裕的武士，竟毅然舍弃财产与地位，与赤贫者为伍，自甘降身为农夫，为每天的口粮而汗流浃背，此情此景，至为动人……
结果，仍是全家被捕，禁于小仓牢狱，细川家转国肥后时，同被逮解熊本。而于武藏来小仓的第二年，宽永十二年十二月，一族十五人，同在花冈山的禅定院中被处决了。
于是，以日本天主教发源地的长崎为中心，附近各地对信徒的迫害、弹压是如火如荼的。
一旦被捕，刑法的残酷无以复加，活焚之刑已是司空见惯。不问男女老幼，或者刀断手指足趾，或者绳穿掌心，或者于严寒中投入海中，或推坠温泉岳沸池之中，种种酷刑，不一而足。
至于搜求信徒的方法，也是竭尽心思、用尽了所有手段，结果乃有所谓“踏绘”(16)的发明。
门徒这种谈话，进入公主的耳中，使她不禁愤慨地想：“虽云邪教，然而刑罚也太过残酷了。”
她的胸中，涌起一股义愤。